Der Virenscanner benötigt eine aktuelle Virendatenbank um effektiv sein zu können. Die Virendatenbank wird über das Internet direkt von F-Secure heruntergeladen. Damit der Intranator immer die neuesten Viren erkennt, sollte die Virendatenbank vollautomatisch aktualisiert werden. Dies wird unter „System > Update > Einstellungen“ konfiguriert. Im Auslieferungszustand aktualisiert der Intranator jede Stunde die Virendatenbank. Ein Update der Virendatenbank kann unter „System > Update > Manuell“ auch von Hand gestartet werden.